Infrastructures, Services
Techniques en laboratoire (In vitro)
Ces techniques expérimentales sont réalisées dans un environnement contrôlé en laboratoire, hors de l'organisme vivant.
Pour demander des services au réseau de laboratoires du CRIPA, complétez le formulaire ci-dessous.
Collection de microorganismes
Lyophilisation
Microscopie électronique
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Colithèque plus de 10,000 souches d'E. coli provenant de cas cliniques de différentes espèces animales, particulièrement le porc.
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Nos installations de niveau de biosécurité 2 permettent la lyophilisation d'agents pathogènes.
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Génération d'images (virus, compartiments cellulaires, bactéries, interactions bactéries-cellules, etc.) dont la résolution peut atteindre 0,08 nanomètre.
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Collection de souches de Streptococcus suis, Actinobacillus pleuropneumoniae, Haemophilus parasuis.
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Autres souches : Staphylococcus aureus, Clostridium perfringens, et autres...
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>3,000 isolats bactériens de poulets
https://www.jenniferronholmlaboratory.com/culture-collection
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Divers virus aviaires et porcins.
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Divers parasites.
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Les collections sont localisées dans plusieurs institutions membre du CRIPA.
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Équipement de pointe.
Plateforme d'imagerie in vivo
Microscopie
confocale
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Plateforme d'imagerie in vivo de nouvelle génération pour l'infectiologie animale post-génomique en animalerie de niveau 2
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Service de microscopie confocale et cytométrie
Formation de biofilms bactériens
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Méthode statique en microplaque.
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Méthode dynamique par la microfluidique (BioFlux).
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Caractérisation en microscopie confocale.
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Mesure de l’efficacité d’un désinfectant ou d’un antibiotique.
Plateforme
robotisée
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Manipulations de grand volume : 42 microplaques 96 puits en simultané
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condition stérile, niveau biosécurité 2 (filtre HEPA)
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Incubateur
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Bonne manipulation de liquide visqueux
Plateforme robotisée 6 tests sérologiques simultanés : Immunofluorescence ou ELISA avec captation d’image.
Bioréacteur
Sartorius BioQ+ bioreactor systems
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three vessel with water jacket (4 °C-50 °C)
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pH probes
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​control acid/base
DasBox Bioreactor
Efficacité
thérapeutique
Phénotype de résistance aux antimicrobiens.
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Concentration minimale inhibitrice (tube ou microplaque).
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L'optimisation pharmacocinétique/
pharmacodynamique (PK/PD) des antimicrobiens utilisés à titre thérapeutique curatif.
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Bioréacteur pour reproduire les conditions du microbiote intestinal.
Système IVIDIS (estomac artificiel)
Réponse
immunitaire
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Antimicrobienne.
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Vaccinale.
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Outils immunologiques (ELISA, Immunofluorescence, Prolifération cellulaire).
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Cytométrie en flux : analyse et triage
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BD LSRFortessa™ X-20 cell analyzer system [4-laser 16-Colour (2B/3R/6V/5YG)]
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BD FACSAria™ Fusion cell sorter system (biosecurity level 2) [3-Laser 11-Colour, with ACDU (5B/3R/3V)] and Hood
Clonage, expression et purification de protéines
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Protéines recombinantes.
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Protéines de fusion.
Développement de vaccins et adjuvants
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Développement de vaccins.
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Développement d'adjuvants.
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Nanotechnologies.
Qualité de l'air et exposition aux bioaérosols
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Mesure en temps réel de différentes fractions micrométriques et nanométriques de particules dans l’air à l’aide de compteurs optiques (ex. DustTrak DRX Aerosol Monitor)
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Échantillonnage des particules en suspension dans l’air et des bioaérosols :
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Échantillonnage statique en solution ou sur filtres à l’aide d’échantillonneurs à très haut débit, jusqu’à 4 000 L/min (ex. Coriolis Micro, SASS® 2300 Wetted-Wall Air Sampler, SASS® 3100 Dry Air Sampler, SASS® 4100 Two-Stage Aerosol Collector)
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Échantillonnage personnel via le port des échantillonneurs par les personnes exposées aux bioaérosols (ex. cassettes 37mm, cassettes IOM, NIOSH Personal Bioaerosol Cyclone Sampler)
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Analyse du contenu biologique de l’air :
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Dosage des endotoxines
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Culture des bactéries et des moisissures et identification des isolats cultivables
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Détection et quantification de microorganismes et de gènes de résistance/de tolérance aux antimicrobiens par qPCR (CFX96 et CFX384 Real-Time PCR Detection Systems, Bio-Rad Laboratories)
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Détection et quantification de microorganismes et de gènes de résistance/de tolérance aux antimicrobiens par qPCR à haut débit (SmartChip Real-Time PCR System, Takara Bio)
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Caractérisation de la diversité en bactéries et en moisissures par séquençage à haut débit des amplicons des gènes de l’ARN16S et des ITS, respectivement
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Génération in vitro de bioaérosols dans des chambres d’aérosolisation dynamiques
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Génération artificielle d’aérosols de bactéries (niveau de confinement 2), de virus eucaryotes (niveau de confinement 2) ou modèles de virus eucaryotes (virus procaryotes ou bactériophages)
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Évaluation de l’efficacité de capture d’échantillonneurs de bioaérosols et comparaison avec des échantillonneurs de référence
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Évaluation de l’impact de la température, de l’humidité relative, des ultraviolets ou de l’ozone ou d’autres désinfectants sur le potentiel infectieux et la survie des microorganismes dans l’air (chambre rotative)
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Évaluation de l’efficacité de capture de masques et de respirateurs (mini-tunnel de vent) ainsi que de filtres mécaniques CVC de 2 × 2 pieds (tunnel de vent ANSI/ASHRAE Standard 52.2-2012)
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Évaluation de l’efficacité d’unités mobiles de purification de l’air (chambre d’aérosolisation de 19,3 m3)
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Étude de la transmission de maladies infectieuses par voie aérienne (chambre d’exposition de furets)