Les technologies dites «omiques» telles que la génomique et le séquençage de l’ADN à grande échelle permettent de générer des quantités importantes de données pour en faire des analyses approfondies.

Techniques "omiques"

Métagénomique
Transcriptomique

Étude du contenu génétique d'un échantillon issu d'un environnement complexe ne provenant pas d'un milieu de culture :
 

  • Technologies de PCR.
     

  • Séquençage (ADN et /ou protéique).

  • Génomique de populations microbiennes (16S, Shotgun).
     

  • Génomique comparative : génomes bactériens et viraux.
     

  • Caractérisation de résistomes (ensemble de gènes de résistance d’une population bactérienne).

  • Analyse des patrons d’expression des gènes (ARN) d'agents pathogènes dans un environnement donné (ex: séquençage d'ARN).

Protéomique
  • Analyse des patrons de production des protéines d'agents pathogènes dans un environnement donné.